Stage : Analyse de la variabilité phénotypique au sein de descendances
Publiée le Mercredi 02 Octobre 2019- Service / Site : Serre expérimentale – Commentry – Allier (03)
- Profil : Connaissances des outils statistiques - Capacité d’analyses et de synthèse - Dynamique, autonome et motiv - Bon relationnel
Lieu : Serre expérimentale – Commentry – Allier (03)
Durée : Possibilité de Février à Fin Juillet / Août 2020
Formation : Bac +5 (Spécialisation Horticole, Agronomie, Amélioration des Plantes)
Description :
L’entreprise Delbard a été créée par Georges Delbard en 1935. La pépinière de Malicorne (Allier) s’étend sur 600 ha où sont cultivés chaque année des rosiers et des arbres fruitiers destinés à la commercialisation. C’est à partir de 1954 que Georges Delbard commence à s’intéresser à la rose. Depuis 2000, la création de nouvelles variétés se fait à Commentry au centre recherche Yves Mazière où se trouvent la serre expérimentale et les tunnels de semis.
Des observations phénotypiques, sur nos nouveaux hybrides de rosiers, sont réalisées chaque année et intégrées dans notre base de données. Ces informations sont ensuite analysées et traitées statistiquement afin de caractériser nos géniteurs.
En parallèle, nous sommes en cours de caractérisation génétique de nos géniteurs à l’aide de marqueurs moléculaires type SNP. Le génotypage haut débit (puce SNP) permettra de relier des caractères phénotypiques à des marqueurs moléculaires qui pourront ensuite être utiliser dans le programme de sélection.
Cette démarche permet au sélectionneur d’optimiser son programme d’hybridation et d’améliorer ses connaissances sur les géniteurs.
Dans ce cadre, nous proposons d’accueillir un stagiaire dont les principales missions seraient :
Phénotypage :
- Participer aux observations sur les descendances de rosiers et les agréger aux données antérieures.
- Analyser les données de phénotypage, via des analyses statistiques (Analyse de variance / Comparaison de moyenne).
- Evaluer le potentiel de nos géniteurs, pour engager une réflexion sur la mise en place d’un outil utilisable par le sélectionneur, dans la construction du programme d’hybridation.
Génétique d’association :
- Participer à la caractérisation moléculaire des géniteurs par la mise en oeuvre et l’analyse du génotypage (puce SNP Affymétrix)
- Corréler les données phénotypiques au génotype via l’utilisation de logiciels de génétique d’association (ex : TASSEL).
Profil :
- Connaissances des outils statistiques
- Capacité d’analyses et de synthèse
- Dynamique, autonome et motivé.
- Bon relationnel
Gratification : indemnisation de stage légale.
Contact :
Mariannick Bouchaud
Responsable Recherche Rosier
mariannick.bouchaud@georgesdelbard.com
Séverine Foucrier
Responsable Recherche Biotechnologies et Création Fruitière
severine.foucrier@georgesdelbard.com